Fra stranda kan du følge jordet innover til du kommer til de første merkene som leder langs stien over mot Gjøhavn. Kilen i Gjøhavn blir hyppig brukt av dykkere. Herfra kan du følge vannkanten langs yttersiden av øya og inn mot Flisbukta der det er spennende å se hva havet har etterlatt seg på land. Du skjønner fort hvorfor bukta har fått navnet Flisbukta.
Innenfor «Porten» finner du et eldorado av bergknauser med gode fortøyningsmuligheter. Det er satt ut mange bolter på Store Vardøyas østside. Her ligger du lunt til for sørvesten. Nord i Vardøysundet mot Store Vardøy grunner det opp mot land. Hele dette området egner seg best for motorbåter. Litt lengre sør finner også seilbåter nok dybde til både baugen inn og longside. Velger du å fortøye mot Lille Vardøya, er det best å ligge longside. Dybdene inn til fjellet er gode, men du ligger noe utsatt til for sørvesten. Bunnen i Vardøysundet består for det meste av sand. Det betyr som regel greit dreggfeste, men det er ikke optimalt.
Gjøhavn er et lunt alternativ nær sagt uansett vindretning. Innseilingen gjennom selve «Perleporten» er forbeholdt båter som ikke stikker dypere enn 1,5 meter. «Porten» er trang, og det går som regel en kraftig strøm her. Seilbåter må gå inn fra sør, vest for Skipholmen. Farvannet er urent og krever et nøye studium av kartet.
